我们在某一超市抽取的食品，经检验，其“菌落种数”项目不符合食品安全标准，经执法人员对超市进行调查，发现其购进该食品的企业为本辖区内另一家食品经营企业（批发），我们在下达行政处罚时，对食品经营企业（批发）进行了立案，并下达了行政处罚事先告知。请问，是否可以同时直接对超市及食品经营企业（批发）进行立案并下达行政处罚？只对超市进行立案并下达行政处罚，那食品经营企业（批发）该如何处理，追溯不合格食品该怎么做才好？如只对食品经营企业（批发）进行立案并行政处罚，那超市这边是否只在调查终结报告做说明，其它的就不用进行处理了？