杀菌系统是否出现问题？管道清刷方法是否得当、彻底。

瓶子，或者是桶装纯净水的桶一般来说只要管道做好了CIP 纯净水应该都是无菌的更别说霉菌了 以前蒸馏设备坏了还悄悄用过纯净水代替过一段时间蒸馏水呢

水源水检测结果如何？

灌装管道有很多死角的

盛装纯净水的是循环使用的瓶子吗？

能导致异常的问题不少，如上面筒子们所说，你一个一个进行排查吧

查查杀菌用的臭氧或二氧化氯的浓度是否有问题？查查杀菌后管道灭菌是否有问题？查查灌装的容器杀菌是否有问题？

灌装的管道杀菌不彻底造成的。