你们如果需要可以要求他们加上

只要是经过备案有效的企业标准就可以。

公司见到一原辅料厂家提供的企业标准，不含致病菌指标，可以吗？

只要成品中能保证没有致病菌就可以了。

从大粪堆里挖出来的萝卜、白菜，是不是也要控制致病菌指标捏？

当然需要验证其提供的企业标准真伪，最好是拿原件扫描件。