首先，三根柱子可以分为两类：HP-5和HP-INNOWAX属于WCOT即壁涂开管柱；HP-PLOT Q属于PLOT柱即多孔层开管柱。两者的最大区别是，WCOT柱是在毛细管管壁涂上的一层液膜，如聚硅氧烷或聚乙二醇；PLOT柱则是在毛细管管壁内涂上的是多孔结构的固体颗粒。多孔层开管柱PLOT比壁涂开管柱WCOT的保留高,选择性独特,更适合挥发组份尤其是气体分析。HP-5固定相是5%苯基甲基聚硅氧烷，是一种弱极性，最常用的色谱柱，应用范围广，使用温度上限高。HP-INNOWAX固定相是聚乙二醇，是一种强极性的色谱柱，适合于分析酸、醇、醛、酯等极性化合物。这类固定相极其怕氧，所以使用时载气最好接氧捕集阱。一般来说，聚乙二醇类的固定相的稳定性不如聚硅氧烷类，它们的使用温度上限相对低一些。另外，这两种柱子是交联键合的固定相，可以进行溶剂冲洗。HP-PLOT Q固定相是键合聚苯乙烯-二乙烯基苯，适合于永久性气体，如C1-C3的异构体，到C12的烷烃，CO2、甲烷、空气/CO、氧化物、硫化物等。在使用PLOT这类柱子时要注意的是，尽管PLOT柱很稳定，但是很难保证颗粒物不会从柱壁脱落。所以在有阀切换或质谱时，使用颗粒物捕集阱。