硼砂有较大的毒性，世界各国普遍禁止将其添加于食品中.硼砂易溶于水，随水温升高溶解度增大。硼砂随食品进入人体后经过胃酸作用转变为硼酸，经由胃肠道吸收;而没有破损的皮肤对硼砂的吸收能力近乎于零。硼砂的实验动物急性毒性为低毒至微毒，但是硼砂在人类显示出了较大的毒性作用。期过量摄入硼，对人体生殖、发育和内分泌系统有毒性影响。短时间摄入大剂量硼，可能导致急性中毒，轻者引起头晕、头痛、食欲不振、消化不良、体重减轻等症状，严重者会出现呕吐、腹泻、休克、昏迷等中毒表现。硼中毒者的病理检查可见胃、肾脏、肝脏、脑和皮肤出现非特异性病变。