微波辐射的危险性取决于暴露的时间长短、与辐射源的距离以及发射装置的功率水平。计算微波辐射的危险性很大程度上取决于它在辐射频谱中的位置，例如位于该列表顶部的伽马射线等高频波，微波频率比无线电波稍强一些，而电视和电脑屏幕的辐射直接低于无线电波，属于极低频辐射。电离辐射也比非电离辐射危险得多，因为它有可能损害人体细胞中的DNA。高能伽马射线，x射线，一些紫外线是电离的，但不是微波。
电离辐射有可能导致未出生婴儿出生缺陷。
比普通可见光更有能量。这并不是说微波辐射根本不构成任何风险，因为暴露在微波炉中是很常见的。不仅微波炉会发出微波辐射，但手机也是如此。
微波炉的主要危险是距离太近。这是一个标准微波炉能发出600-700瓦的能量来烹调食物。根据美国联邦的指导方针，使用中的微波炉允许的辐射泄漏量为5毫瓦，即每平方厘米0.005瓦（5兆瓦/平方厘米）这种辐射泄漏也会以距离辐射源1平方英寸的距离下降10倍。如果有人在微波炉工作时距离微波炉1英寸（2.5厘米）的距离接收到5毫瓦的辐射，后退10英寸（25.4厘米）的距离将使辐射量减少100倍，或者0.00005瓦特。
相比之下，手机的微波辐射水平大约是每平方厘米1毫瓦（1兆瓦/平方厘米）电话信号通常在300瓦的范围内。在靠近手机发射塔的房屋中，典型的微波功率水平比国际辐射防护协会（IRPA）规定的限值低100万倍。
微波炉辐射的能量低于普通可见光。
将手机及其接收天线稍微远离头部，将其装入便携袋中，或者使用耳麦，这样装置就可以在一定程度上减少暴露在微波辐射下的程度。然而，关于手机潜在危险的研究仍在继续，特别是在成长中的儿童使用手机的地方。警察在巡逻车中使用的雷达探测器也会产生微波，目前正在对这些单位进行研究，以确定是否存在长期暴露风险，但迄今为止，证据尚未显示出任何不良影响尽管有这一消息，俄罗斯的研究表明，长期暴露在极低水平的微波辐射下会造成健康风险，这导致俄罗斯和欧盟的安全限值为1 mW/cm2，而美国的安全限值为5 mW/cm2。
手机的微波辐射水平约为每平方厘米1毫瓦（1毫瓦/平方厘米）。
从2011年起，微波辐射的危险可能是它在烹调时对某些食物分子造成的潜在风险，以及矿物质分解成更小的分子，这些小分子几乎没有营养价值。烹饪过程也会产生放射性化合物，这些化学物质被辐射作用分解，可能会对健康造成危害，例如致、降低或损害记忆。由于这些未知因素，在医院里，婴儿配方奶粉和输血用的血液从来不会被微波辐射加热。众所周知，某些软塑料食品包装如果被用作容器或微波炉的覆盖物，就有可能将塑料化合物渗入食品中，因此，我们建议食物只能在明确为微波安全的玻璃或塑料中进行微波炉加热。
来自蜂窝塔的微波传输通常为300瓦。