县内，不同生产加工场地，办理食品生产许可，该如何操作

可以做到一证双址，把你另外那个乡镇的车间算作你公司的另一块生产区域就可以了，不过这个要涉及到到时候变更营业执照等手续。另外目前食药监体系正在改革，不知道你们那边进度如何了，建议在体制调整前抓紧弄掉，不然体制调整后衔接手续可能有麻烦

可以考虑做增项申请，申请增加生产场地，具体可以咨询下当地的监管部门。