自《有机产品认证管理办法》实施后，对有机产品认证的过程有了更明确的规定。消费者可以通过可追溯性有机码查询到有机产品信息，确保购买到合格的有机产品。
深圳检验检疫局认证处负责人陆奇能在接受媒体采访时曾表示，2013年4月1日实施的《有机产品认证管理办法》与之前的有机产品认证管理办法是有区别的：此次《有机产品认证管理办法》中，对有机产品新增了一个17位数的有机码。
有机码也叫溯源码，为保证有机产品的可追溯性，国家认监委要求认证机构在向获得有机产品认证的企业发放认证标志或允许有机生产企业在产品标签上印制有机产品认证标志时，必须按照统一编码要求赋予每枚认证标志编码，该编码由17位数字组成，其中认证机构代码3位、认证标志发放年份代码2位、认证标志发放随机码12位，并且要求在17位数字前加“有机码”三个字。
消费者可以登录国家认监委官方网站中的“中国食品农产品认证信息系统”查询每一张有机认证证书的相关信息，证书信息中标示了认证机构、证书编号、获证企业、认证证书类型、认证产品名称、生产基地名称和地址、认证年产量等。“155号令要求有机产品认证过程中需认证机构现场检查、产品检测、环境监测这三个环节。”此外，《有机产品认证管理办法》对进口有机产品的标准规定更明确。它规定进口有机产品需要国家认监委认定的国内认证机构有机认证。以农产品为例，美国有机产品农药残留标准其实比国内的低，美国标准为不超过安全标准的5%，而国内标准则是零容忍。
有机认证新规实施之前，消费市场上存在大量的有机转换产品。据了解，有机转换产品与真正的有机产品是有差距的。宁波市质监局合格评管处工作人员介绍说，真正的有机产品，一般要经过2~3年的转换期，在此期间的产品不能叫有机产品，只能叫“有机转换产品”。而2013年4月1日起实施的《有机产品认证管理办法》，则取消了有机转换认证标志，有机产品获得认证前仍然要经过2~3年的转换期，转换期产品只能作为常规产品销售，从而有利于消费者统一识别有机产品，从根本上杜绝了利用有机转换认证冒充和混淆有机认证的违法行为。此外，对于谁有资格来认证有机产品，新规也有说明：有机产品由国家认监委批准的第三方机构来认证。
目前在国内，有资格做有机产品认证的机构达20多家，多分布在北京、广州、上海等大城市。为了防止以假乱真，现在第三方认证机构会根据有机生产企业的产量来颁发相应的认证标志和销售证，进一步规范了有机产品的市场秩序。
