问题很好！液相、质谱含测原理不同，化合物性质也有差异，应该没有固定的5%、10%的差异，要根据具体情况分析。很少见到含量测定差异比较这方面的研究。你接下来要做什么实验？

待测物浓度高低是否也会影响两种方法的准确性或结果的一致性？

这个不好说

最理想状态应该是相同的结果，但由于仪器和处理方法的不同可能会存在差异，这个差异具体是多少很难说，自己可以多做几次看看，有国标的应以国标为基准，其他为参照。

不管液相还是质谱都单独进对照，用对照算结果这样差别会不会应该小呢

质谱与液相没有绝对谁测的更准的，如果两种方法结果一致且都能通过各自的谅学验证，一般误差在2%以内，说明两种方法一样好，如果结果不一致至少说明其中一个方法有问题或检测人员做的有问题。

你要注意你用的是什么来计算含量，是外标法还是面积归一法或者是内标法。。如果是用外标法，应该不会差很多。。