新食品安全法中第123条中并可以没收用于违法生产经营的工具、设备、原料等物品

这个和旧法相比，已经进步了，是可以没收，当然不像旧法，无论是何种情况就是没收。我们在执法时可依据违法情节进行实际处理。

执法部门有权可以任性。

行政处罚法有相关要求。

应该是根据情节轻重、性质恶劣程度等因素由执法部门进行自由裁量吧。一般执法部门都会制定自由裁量的具体细化操作规定的

依违法的主观性来判定吧

这就是单处和并处的裁量问题了，视具体情节吧。