实验室通常包括操作间和无菌室。无菌室又包括预备间和工作间两大部份。为了便于无菌处理，面积容积不宜过大，以适宜操作为准，一般可为9～12㎡。预备间与工作间的比例可为1﹕2，高度2．5左右为适宜。工作间内设有固定的工作台、紫外线灯、空气过滤装置及通风装置。较为理想的应有空调设备、空气净化装置，以便切实达到进行微生物工作时无尘无菌。工作间的内门与预备的门力求迂回，避免相通，以便保持工作间的无菌条件。窗户应装有两层玻璃，以防外界的微生物进入。