隧道式巴氏杀菌机是一种处理那些已经灌装好了的容器方法。巴氏杀菌机没有经过处理的产品灌装进容器，并将容器封好盖，然后，通过输送带的传送，进入隧道式巴氏杀菌机的内部。在巴氏杀菌机中的各个温度区域内，巴氏杀菌机产品的温度受到精细的调节。当通过隧道时，容器受到不同温度水的喷淋，也就是加热阶段、杀菌阶段和冷却阶段。

巴氏杀菌机前端的逐步加热和后端的逐步冷却是非常重要的。巴氏杀菌机这样，既可以避免过热而造成的口味损失，又能够防止容器热应力的突变而产生的碎瓶。

在隧道式巴氏杀菌机中，巴氏杀菌机一般可以采用三种热传递方法：一种是喷淋板上面带有许多喷淋孔（可称之为：喷淋板系统），热水通过喷淋板喷淋到容器上；另一种是安装一个大型的喷淋嘴（可称之为：喷淋嘴系统），热水通过这个喷淋嘴喷淋到容器上；第三种是在四方的喷淋管上面开设槽口（可称之为：喷淋杆系统），热水通过喷淋杆喷淋到容器上。

目前常用的是喷淋板系统，这种系统结构简单、实用。喷淋杆系统同样具有喷淋水分布均匀的特点；由于喷淋嘴系统的结构简单、坚固，因此，喷淋嘴系统的维护保养比较方便。