常用的食品杀菌方法包括高温杀菌、巴氏杀菌、冷冻杀菌、电流杀菌、高压杀菌等。然而，这些设备大多体积庞大，加工时间长，灭菌不干净或难以实现自动化生产，且危险性大。同时，它经常影响食物的原有风味和营养成分。
以前流行的钴60辐射灭菌，可以用电离辐射完全灭菌，但不清楚是否有残留辐射，所以欧盟对辐射灭菌有一定的限制，现在大多数厂家采用微波烘干杀菌设备进行快速烘干和灭菌。
微波烘干杀菌设备快速烘干和杀菌，会使食品中的昆虫、细菌等微生物受到微波热效应和非热效应的共同作用，使其蛋白质和生理活性发生变异，导致微生物的延迟和死亡，从而达到杀虫、杀菌和保鲜食品的目的。微波可以在较低的温度下杀菌杀虫。
它可以粉状、片状和颗粒状的食品和药品等。加热速度快，不受材料厚度和形状的影响。对细胞的生物学效应是微波电场改变细胞膜横截面的电位分布，影响细胞膜周围的电子和离子浓度，从而改变细胞膜的通透性，导致、代谢异常、细胞结构和功能紊乱，借此达到杀菌的目的。
另一方面，在微波烘干器的作用下，食物中的昆虫和细菌也会因分子吸收微波能量而升温。因此，体内蛋白质受到非极性热运动和极性旋转的双重影响，其空间结构被改变或破坏，导致蛋白质变性。蛋白质变性后，其溶解性、粘度、膨胀性、渗透性和稳定性会发生明显变化，失去生物活性。这就是微波灭菌的原理。
微波烘干杀菌设备是可以定制的，主要用于快速烘干食物。其主要功能有：快速烘干、烘干等。类型有隧道式、箱式、立式柜式、真空式、常压式、小型和大型工业式、带式、动力式、低温式、节能环保式。