纳他霉素是一种安全系数较高的添加剂，主要用于糕点等食品中，比如乳酪、面包以及饮料等。

纳他霉素属于一种天然、广谱以及高效安全的酵母菌、霉菌等丝状真菌抑制剂，属于多烯大环内酯类。既可以广泛抑制各种霉菌、酵母菌的生长，还能抑制真菌毒素的产生，广泛用于食品防腐保鲜，起到防腐、延长保质期的作用。

此外，纳他霉素还可被用于治疗真菌感染，比如假丝酵母菌、曲霉菌以及镰刀霉菌等。因此也被用作眼药水或口腔药剂中。