两者规范的目的不同，GMP是企业进行生产应该具备的基本卫生条件，是基础；HACCP是控制危害（一般有物理性的、化学性的和生物性的危害）的保证食品安全的管理体系，通过对原材料、加工工序进行危害分析形成关键控制点，制定关键控制点控制程序。GMP是HACCP的基础

GMP、SSOP是HACCP的基础，乳制品企业只能拿乳品的HACCP认证，现国内只有：方圆和中大华远两家具备资格。

其一、依据的标准不同，GMP依据是GB12693，乳制品HACCP依据是GB/T27341和GB/T27342。其二、GMP是乳制品HACCP认证的前提要件，必须满足乳制品企业良好操作规范才有资格进行HACCP认证。