首先要弄清楚，是个别现象还是整批都是这样，也不排除包装上的缺陷，比如未完全密封，包装物本身带有产气菌等，你可以按照CCP的要求对每步做个验证。

乳品是不允许二次灭菌的。即使允许，这样做也会对蛋白质产生影响的

1.PE瓶根本不耐高温应该使用PP瓶才对2.你用水浴槽灭菌,不知你如何确保瓶口的密合度,换句话说就是如何确保产品完全密闭不会于冷却时跑入冷却水?

我认为二次灭菌温度好象有问题。首先我想知道一个问题，你标明的80度是水温还是瓶内饮料的温度；再者我们一般进行二次灭菌乳饮料生产的时候二次灭菌温度没有低于95度的，即使是乳酸菌饮料也是如此，而且必须是保证容器内饮料的温度达到95度以上保持20~30分钟，否则是容易出问题的。

个人意见，温度过高会严重影响产品风味，并破坏营养成分。可以考虑适当增加灭菌时间，温度不宜过高。