生产上用于制曲，如酱油、酒类，我酒想问的就是：保藏菌种用于生产是否合适？还是市场上一些提供菌种的生产厂商的菌种适用？

不知你是用来干什么？具体的菌种要具体分析，不能一概而论。譬如：一些基因工程菌菌种一般由科研院所开发出来，所以可直接从科研院所。象CICC的菌种主要是保藏的经典，要在生产上有优势，一般还需要诱变、筛选。