为了提高木耳菜嫩头产品的质量和产量，需要进行植株调整。在苗高约　33厘米　时，留基部3～4叶收割嫩头，选留其中2个强壮侧芽成梢，其余抹去；收割二道稍后，选留2～4个强壮二级侧芽成梢，其余抹去。在生长旺盛期，可选留5～8个强壮的侧芽成梢。中后期，应尽早抹去花茎幼蕾。到了收割末期，可进行整枝，留1～2个强壮侧芽成梢。这种整枝有利于叶片肥大，梢肥茎壮，品质好，收获次数多，总产量高。

采收嫩头时，一般用刀割或剪刀剪，以10～20厘米长为宜。收割头梢后，每隔5～7天采收一次，旺盛期3～4天采收一次。一般亩产2500～3500千克。