冷冻干燥机由制冷系统、真空系统、加热系统、电器仪表控制系统所组成。主要部件为干燥箱、凝结器、冷冻机组、真空泵、加热/冷却装置等。
　　一、开机前准备：
　　1.打开机箱左侧的总电源开关，气压数显为大气压110pk；
　　2.按住控制面板上的总开关键三秒钟以上，温度数显为冷阱的实际温度；
　　3.启动制冷机，预冷三十分钟以上；
　　4.将样品放入样品架，盖上有机玻璃罩，并启动真空泵；
　　5.待气压数显稳定后，记录温度和气压数值。
　　二、停机程序：
　　1.纪录停机前的温度和气压数值；
　　2.按住控制面板的充气阀，并立即关闭真空泵；
　　3.气压数显为大气压时，打开有机玻璃罩，取出样品；
　　4.关闭制冷机，按住总开关键三秒以上，后关闭总电源开关；
　　5.等冷阱中的冰完全化成水后，打开机箱左侧的出水阀放水，并用干布清洁冷阱内壁，盖上大张滤纸防尘。
　　三、冷冻干燥机注意事项：
　　1.制备样品应尽可能扩大其表面积，其中不得含有酸碱物质和挥发性有机溶剂；
　　2.样品必须完全冻结成冰，如有残留液体会造成气化喷射；
　　3.注意冷阱约为零下65度，可以做低温冰箱使用，但必须戴保温手套操作防止冻伤；
　　4.启动真空泵以前，检查出水阀是否拧紧，充气阀是否关闭，有机玻璃罩与橡胶圈的接触面是否清洁无污物，良好密封；
　　5.一般情况下，该机不得连续使用超过48小时；
　　6.样在冷冻过程中，温度逐渐降低，可以将样品取出回暖一段时间后（仍处于冰冻状态），继续干燥，以缩短干燥时间。