番茄芽通常是由种植的番茄种子或腐烂并释放出种子的番茄种子发育而来的。然而，在一个完整的西红柿内部生长的番茄芽并不少见。通常番茄种子周围的凝胶会在番茄完好无损或甚至在番茄掉到地上之后抑制发芽而且已经腐烂了。只有在有利于种植西红柿的条件下，才允许种子发芽；例如，种子将在春天发芽，而不是在冬天发芽。但是，有时，温度波动会导致番茄内发芽。
番茄芽不太可能让人生病，但通常避免。
这些番茄芽以及番茄叶和茎在很大程度上已经在烹调中避免使用。一些厨师已经成功地用它们来给调味汁和其他一些番茄菜肴添加一种独特的番茄风味，但应该注意的是，在这种情况下，茎和叶被文火煨过以调味，然后去掉；西红柿不被食用，原因是西红柿属于茄科植物，该科许多植物的叶、茎和未成熟的果实都具有毒性，如果吃西红柿会引起健康问题。
番茄属于茄科植物，茄子和土豆也一样。
番茄中以及番茄植株的叶和茎中都含有一种被称为番茄碱的糖类生物碱，这种生物碱对有不良影响，并会刺激胃有些人仅仅接触番茄叶也会产生，而对于动物来说，尤其是狗，吃番茄植物有时会致命。
，长期以来，未成熟的西红柿被用于许多食品配方中，而不会对任何人造成伤害。许多人也吃了发芽的西红柿，但没有任何明显的不良影响。实验室对动物的实验表明，番茄碱不会被人体吸收，而是会随着不需要的胆固醇一起排出体外。番茄碱还被发现有很强的毒性抗微生物的特性和对的生长有威慑作用。
看来，少量食用西红柿碱是安全的。它需要大量的番茄芽、叶和茎，才能给人一剂有毒的剂量；吃一两片不太可能引起任何健康问题。不过，如果有什么问题的话如果怀疑或者有任何过敏问题，好不要吃发芽的西红柿。