1、提高水产动物的生长性能，主要通过①促进肠道有益菌的增殖，抑制病原菌和腐败菌；②肠道组织变厚增生、重量增加，肠绒毛高度增加，肠壁黏膜变薄，从而增强消化功能，更好地消化吸收营养物质；③促进矿物质元素的吸收，寡糖发酵产生的酸性物质能吸附钙化合物使其溶解性增加，从而导致钙吸收能力增强；④生成营养物质，双歧杆菌在肠道能合成维生素B1、维生素B2、维生素B6、维生素B12、烟酸、叶酸和各种氨基酸。2、影响鱼类的肠道微生物，能改善动物消化道微生物区系，促进消化道有益菌的生长，抑制有害微生物的繁殖。3、影响鱼类的血液生化指标水平，降低血清中甘油三酯和胆固醇浓度，进而改善脂类代谢，同时还能够降低血液中的尿素氮水平，提高蛋白质沉积率，降低尿素在肾脏中的沉积，从而减少肾脏尿素中毒的可能性。4、增强水产动物的免疫功能，刺激机体免疫应答。5、改善水产动物的养殖用水，壳聚糖能吸附养殖用水中的重金属离子，净化养殖用水环境，防止水质恶化，影响水产动物质量。